سوال1 - آیا آنزیم های محدودکننده بر DNA ی باکتری ها اثر نمی گذارند ؟ چرا باکتری ها چنین آنزیمهایی را تولید می کنند؟

جواب1: چنانچه توالی جایگاه شناسایی آنزیم در DNA باکتری وجود داشته باشد توسط آنزیمی خاص تغییر می کند تا قابل شناسایی نباشد به این صورت که یک گروه متیل به یک یا چند باز در جایگاه شناسایی اضافه می شود ودر نتیجه DNA توسط آنزیم محدوده کننده شناسایی نشده و بریده نمی شود. دلیل تولید چنین آنزیمهایی در باکتریها این است که باکتریها بتوانند در برابر باکتریوفاژها از خود دفاع کنند. هنگامیکه یک باکتریوفاژ DNAی خود را به درون باکتری تزریق می کند اگر باکتری دارای آنزیم محدود کننده باشد میتواند DNA ویروس را متلاشی کرده واز خود دفاع کند.

 سوال 2 - آیا برای تولید انسولین در باکتریها ژن گسسته انسولین ( مجموع اگزون ها واینترون ها) را به درون باکتریها می فرستند واگر چنین است چگونه mRNA اولیه در باکتری پردازش میشود؟

  جواب 2: برای تولید انسولین مولکول( cDNA(complemenntary DNA انسولین را درون پلازمید قرار می دهند  وبه درون باکتری می فرستند که این مولکول فاقد اینترون هاست .برای ساخت cDNA ابتدا mRNA بالغ پروتئین انسولین را استخراج و جداسازی می کنند وبه کمک آنزیم رونوشت بردار معکوس یک رشته مکمل DNA از روی آن می سازنند.سپس باآنزیم ویژه ای رشته mRNA را تخریب می کنند وبه کمک آنزیم DNAپلی مراز رشته دوم DNA را می سازنند. ملکولی که به این صورت ساخته می شود cDNA دو رشته ای است و فاقد اینترونهای ژن است .در ضمن باکتریها توانایی پردازش RNA را ندارند. 

 سوال 3 - آیا نقش rRNA در تشکیل پیوند پپتیدی قطعی است ؟و چرا در کتاب درسی جمله  « به نظر میرسد...» آورده شده است؟

جواب 3 - امروزه مشخص شده است که یک مولکول  rRNAدر زیر واحد بزرگ ریبوزوم موسوم به ریبوزیم(Ribozyme) پیوند پپتیدی را کاتالیز می کند.این واکنش خودبه خودی است و نیاز به انرژی اضافی ندارد چون ATPدر مرحله تشکیل آمینواسیل-tRNA انرژی خود را منتقل کرده است.